Trong những năm cuối thập niên 1990, bệnh circovirus ở lợn đã được phát hiện do một loại circovirus mới (Porcine Circovirus – PCV) gây ra. Virus này khác với PCV thích ứng trên môi trường tế bào thận lợn PK15 đã biết trước đó. Virus mới phân lập được gọi là PCV type 2 (PCV2). Dịch tễ học PCV1 được phân lập lần đầu tiên ở Đức vào năm 1974, virus này không gây bệnh ở lợn. Năm 1997 tại Pháp, PCV2 được nhận diện là nguyên nhân gây hội chứng gầy còm ở lợn